單細胞分析平台

Single Cell Analysis Core Facility

C5-單細胞基因表達分析儀

BD Rhapsody

BD Rhapsody

提供單一細胞編碼與基因建庫分析、外泌體建庫、微量核糖核酸之絕對定量與相對定量分析與應用。

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單細胞基因表達分析儀

儀器描述

BD Rhapsody™ Single-Cell Analysis System 是一台高通量單細胞基因製備系統，透過Rhapsody特有蜂巢式卡夾，可以同時分離10,000顆細胞進行基因庫製備，一次標定多組細胞並同時進行分析，有效降低所需基因庫製備費用。

主要特點

  • 1. 透過具有專利技術的分子索引核酸序列 (Unique Molecular Indexing) 單顆磁珠，可以標定原始單細胞基因並精準計算基因原始套數(Copy Number)。
  • 2. 透過抗體標定技術及多重樣本試劑組(Sample Multiplexing Kit)，可有效分離不同批次細胞並同時進行基因庫製備。透過不同基因庫製備試劑可以專一分析標的基因(Targeted Assays)，有效降低核酸定序費用。
  • 3. 全基因組分析 (Whole Transcriptome Assay, WTA) 可用來檢測單細胞基因表現差異與細胞種類鑑定。
  • 4. 以磁珠純化的cDNA可以保存12個星期以上，樣品可分批進行不同基因庫製備。
  • 5. BD Rhapsody具備細胞影像掃瞄系統，提供LED 482nm及635nm激發光，可偵測綠光513nm-563nm與紅光662nm-707nm。BD Rhapsody搭配530nm光源亦具有可掃描明視野影像 (Bright field)。
  • 6. 可計數活細胞濃度(cell/ul)、死細胞濃度(cell/ul)、總細胞濃度(cell/ul)及活細胞百分比，以精確控制其後的分析為活細胞的基因表達。
  • 軟體支援：提供seqgeq軟體分析
  • 多重樣本試劑組限制：
    ■ 目前提供人類全細胞種類使用
    ■ 小鼠細胞僅提供免疫細胞使用

儀器操作

受正式教育訓練核可後自行操作與專人操作服務等，並依據需求訂定專案處理。

放置地點

國家生技研究園區A棟5樓A512室

管理人員

技術專員：蕭志強

電子信箱：as0210241@gate.sinica.edu.tw 

專案經理：簡皎芸博士

電子信箱：happyepi@gate.sinica.edu.tw

電話：02-7750-5500#1478

Description

BD Rhapsody is a high throughput single cell prep system. The Rhapsody can capture more than 10,000 cells by using the cartridge. The UMI labeled magnetic bead can bind mRNA from individual cell for library preparation which effective decrease the reagent cost.

Main specification

  • 1. Through unique molecular identifiers (UMI) labeled magnetic beads technology, the BD Rhapsody system can label single cell mRNA with UMI for whole transcriptome analysis.
  • 2. With BD Ab-seq and multiplexing technology, you can input cells from different treatment and mix for library preparation. The gene targeting panel can detect gene set and decrease DNA sequence cost.
  • 3. Whole transcriptome analysis (WTA) can identify the differential genes expression profile and identify the cell types.
  • 4. The magnetic beads linked cDNA can be stored for 12 weeks, and samples can prepare for several applications.
  • 5. BD rhapsody system have cell image system, provide 482nm and 635nm excitation light and can detect 513-563nm and 662-707nm emission light. BD Rhapsody also have 530nm light for bright field image.
  • 6. The build-in cell scanner can automatic count live cells and dead cells density, total cell concentration, and the live cell ratio.
  • Supported software: Seqgeq software
  • Multiplexing limitation:
    ■ Human: for all cell types
    ■ Mouse: only for immune cells (CD45+ cells)

Site

National Biotechnology Research Park Building A, 5th Floor, room A512

Manager

陳志龍

Email：jyhlong@gate.sinica.edu.tw

TEL：02-7750-5500#1478

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